La Collégiale abrite un prestigieux trésor, connu internationalement, dont les pièces principales sont un ensemble de quatre grandes châsses des 12ème et 13ème siècles.
Celle de la Vierge dont la restauration a été terminée pour le récent réaménagement (2012) de la crypte romane.
Celles de Saint-Mengold et de Saint-Domitien et celle de Saint-Marc aux émaux remarquables.
D'autres pièces également exceptionnelles sont à découvrir dans la crypte: le médaillon émaillé de l'Arbre de Vie", chef d'oeuvre de l'art mosan (Vers 1160), le calice et la croix funéraires de Théoduin de Bavière (1075), la relique de la Vraie Croix ainsi que des orfèvreries remarquables hutoises et liégeoises.